Aufgrund der Kritik an der ersten Version des Systems, siehe ÖStZ 2013/793 und ÖStZ 2014/68, hatte das BMF Ende März Verbesserungen angekündigt, die nun umgesetzt wurden. Nach einer mehrwöchigen Testphase ist mit 25. 6. 2014 - dem Tag des Inkrafttretens der dafür erforderlichen Änderung der Pendlerverordnung mit BGBl II 2014/154 - die überarbeitete Version des Pendlerrechners ("Pendlerrechner 2.0") online gegangen.